選舉結束，
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，因立委先在二月一日就職，
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，出現在五月廿日馬總統卸任前近四個月新舊民意不一致的問題。馬總統一本初衷，
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，選後尊重新民意，
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，希望釋出組閣權，
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，與總統當選人蔡英文協調過渡期內閣的籌組，
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，以期新舊政府無縫接軌，
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，國政推動不致因五月的政權交接延宕。此次因總統立委合併選舉，
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，情況異於二○○八年，為我國憲政實踐中首見，該如何做出符合憲法精神的因應之策，朝野應捐棄成見，共商對策，建立慣例，此亦為朝野和解之伊始。中華民國憲政體系目前仍為偏向總統制的雙首長制，故行政院長的任命與辭職，均應依照憲法增修條文第三條由總統核定，行政院長之進退是由總統決定。然而，在我國的憲法實踐中，即使面對選後之新民意而有總辭，以示對新民意之尊重慣例，具內閣制之色彩，但就憲政體制而言，閣揆之去留仍是由總統決定，至於如何因應新民意下而做出新布局，亦屬總統的政治判斷下的行政裁量權。隨著內閣選後提出總辭，馬總統尚未批准下，經濟部長鄧振中表示，內閣看守期間，全面暫停兩岸貨品貿易談判；鄧振中也指出，財經業務繁多，不宜因內閣總辭而暫停所有經濟事務，但基於尊重新民意，亦不宜推動新政策，凸顯我國在「雙首長」憲政制度設計下，即將卸任總統對下屆總統的尊重及政務官面臨新民意的取捨。惟既然蔡英文認為我國憲法不存在國會多數黨組閣的必然性，直至馬總統任期屆滿前，各層級政務官於既有政策之推動不應懷有「看守」心態，仍須上下一心，依法執行職務，絕不可造成所謂的政策「空窗」。選舉雖造成新、舊民意之別，但國家為永續，外在於台灣之政經情勢危懼，國政不容須臾中斷，企盼朝野殫精極慮，共謀新、舊政權過渡期內閣組成之道，以人民為念，賡續政務，方為國家之幸。，